Akademi Pengajian Islam Kontemporari atau Academy of Contemporary of Islamic Studies (ACIS) ditubuhkan pada Disember 2012 bagi menggantikan Pusat Pemikiran dan Kefahaman Islam atau Centre for Islamic Thought and Understanding (CITU). Penambahbaikan ini dilakukan bagi membolehkan ACIS menawarkan program pengajian sama ada di peringkat diploma, ijazah, sarjana atau PhD, dalam usaha memartabatkan pengajian Islam di negara ini khususnya dan di peringkat antarabangsa amnya.

Mulai tahun 2018, dengan mengambil kira segala kepakaran yang dimiliki oleh para pensyarah, ACIS UiTMCT telah mengorak langkah yang lebih terkedepan apabila telah berjaya menawarkan satu program baru iaitu Program Diploma Muamalat (DIM) dengan penerimaan pelajar bagi kohort pertama bermula sesi pengajian Interim Julai 2018.